Fernando Leite nasceu em Nacala-Velha, Nampula, Moçambique, em 1954.
Licenciou-se em Engenharia Civil na Universidade Eduardo Mondlane. Doutorou-se na Universidade Técnica de Dresden, Alemanha. Ingressou no corpo docente da UEM em 1977, onde leccionou as matérias de Vias de Comunicação durante cerca de 15 anos, tendo ascendido à categoria de Prof. Auxiliar.
Esteve ligado, como Consultor para a área da formação à Administração Nacional de Estradas (ANE) durante cerca de 10 anos, onde foi responsável pela organização e leccionamento de cursos sobre manutenção de estradas de diferentes níveis e para diferentes tipos de técnicos, bem como pela elaboração de diferentes manuais.
Foi membro do Conselho de Administração do Laboratório de Engenharia de Moçambique e do Conselho de administração da ANE. Em paralelo com a actividade docente universitária, tem desenvolvido actividade de consultoria para diferentes empresas, no domínio da pavimentação e drenagem de infraestruturas para transportes.
Está desde 2005 ligado ao ISUTC, onde exerceu a coordenação do Departamento das Tecnologias da Construção até Dezembro de 2010. Tem a categoria de Professor Associado e tem desenvolvido trabalhos de investigação na área dos materiais para pavimentação.
Desde Janeiro de 2011 exerce o cargo de Director Geral do ISUTC.